基本は入院治療ですが、外来では治療方針を決めるための各種検査を行います。検査としては、血液・尿検査、画像検査（超音波、ＣＴ、ＭＲＩ、シンチ）、細胞診検査や生理検査（心電図、呼吸機能など）を実施します。 退院後は外来通院にて経過観察を行います。基本的には退院後1年は毎月1回の通院を、2年目からは2ヶ月毎に、3年目は3ヶ月毎となりますが、病状によりその間隔や通院期間は異なります。 定期的に血液・尿検査、超音波検査が行われます。膀胱癌では膀胱鏡を、全ての癌でＣＴ検査も年に1～2回行います。
前立腺癌に対してホルモン療法が行われている場合は、病状にもよりますが、1～3ヶ月毎に通院して、投薬と注射またはどちらかが行われます。定期的に腫瘍マーカー（ＰＳＡ）を測定します。 外来で抗癌剤を投与することもあります。

結石の位置と大きさによりますが、基本的には自然排石を促す保存的治療を最初に行います。
3ヶ月経過しても自然排石されない場合、尿路感染症を合併している場合、腎機能が低下している場合では入院治療となります。保存的治療では、生活指導と薬物内服となります。 尿検査と画像検査（超音波、単純X線撮影：KUB、場合によりCT）を行います。通院は2～4週間毎になります。尿路結石を繰り返す場合には、ホルモン検査なども行います。
手術はレーザーを用いた経尿道的内視鏡手術を実施しています。

38度以上の発熱があり、重症または重症への移行の危険性が高い場合は入院治療となります。外来では、薬物内服が基本ですが、点滴通院が必要な場合もあります。 重症度を判定するために、尿・血液検査、尿培養検査と超音波検査、場合によってはCT検査も行います。再発を繰り返す場合には、膀胱鏡検査なども行います。 通院は1～2週間毎になります。

ここ10年間で次々と新薬が出てきました。新薬をいろいろと使い分けることで、症状の緩和が期待できるようになりました。 ただし、完治は難しく、症状にあわせて、薬剤の変更や、休薬して治療していきます。また、前立腺肥大症では、手術を行うこともあります。 当院では手術の第一選択として経尿道的レーザー前立腺切除術（ＨｏＬＥＰ）を行っています。また膀胱機能の低下による高度の残尿を認める場合には、間歇導尿やカテ?テル留置が行われます。 排尿障害がある場合、膀胱炎の合併や腎機能の低下が時に起こりますので、通常1～3ヶ月毎の通院が必要です。

本院の腎臓内科と協力して、主に手術(内シャントの作製・修復、人工血管の移植、腹膜潅流カテーテルの腹腔内留置)を実施しています。